Trong quá trình điều tra, Công an tỉnh An Giang xác định: Nguyễn Văn Giỏi đã trực tiếp chỉ huy, điều hành hoạt động thi công, phụ trách chất lượng, kỹ thuật thi công và nghiệm thu khối lượng hoàn thành của hạng mục "Đắp bao tải cát dưới nước xử lý hố xối bằng sà lan 200T" thiếu gần 14.000 m³ khối cát, gây thiệt hại cho ngân sách Nhà nước trên 9,6 tỷ đồng; đồng thời, thiếu 6 thảm đá của hạng mục thả thảm đá gây thiệt hại cho ngân sách Nhà nước trên 60 triệu đồng đối với Gói thầu số 11 thi công xây lắp hạng mục xử lý sạt lở khu vực thị trấn Vĩnh Thạnh Trung (Đoạn 1) thuộc Dự án xử lý sạt lở khẩn cấp sạt lở bờ sông Hậu (đoạn qua thị trấn Vĩnh Thạnh Trung và xã Bình Mỹ, huyện Châu Phú, tỉnh An Giang).
Sau khi tống đạt các quyết định và lệnh bắt tạm giam, Cơ quan Cảnh sát điều tra, Công an tỉnh An Giang đã khám xét nơi ở, nơi làm việc của bị can Giỏi, thu giữ nhiều tài liệu có liên quan để phục vụ điều tra.
Vụ án đang được Công an tỉnh An Giang tiếp tục mở rộng, điều tra.