Về cơ cấu tổ chức, so với trước đây, bộ máy của Cục Đăng kiểm Việt Nam được tinh gọn tối đa theo hướng tổ chức lại từ 50 đầu mối xuống chỉ còn 17 đầu mối giảm 33 đầu mối. Cục Đăng kiểm Việt Nam có 22 nhiệm vụ và quyền hạn, giữ vai trò nòng cốt trong quản lý Nhà nước về đăng kiểm, an toàn kỹ thuật và bảo vệ môi trường đối với phương tiện, thiết bị giao thông vận tải.
Cục cũng sẽ tham mưu, giúp Bộ trưởng Bộ Xây dựng xây dựng và ban hành hoặc trình cấp có thẩm quyền ban hành các chương trình, đề án, văn bản quy phạm pháp luật về đăng kiểm. Đồng thời, Cục chủ trì xây dựng, trình ban hành hoặc đề nghị thẩm định, công bố hệ thống tiêu chuẩn quốc gia, quy chuẩn kỹ thuật quốc gia liên quan đến phương tiện, thiết bị giao thông vận tải; phương tiện, thiết bị thăm dò, khai thác, vận chuyển trên biển; cơ sở đăng kiểm, cơ sở đóng mới, hoán cải, sửa chữa phương tiện; cũng như các quy định về sử dụng năng lượng tiết kiệm, hiệu quả.
Cục sẽ thực hiện cải cách hành chính, cung cấp dịch vụ công; tiếp công dân, giải quyết khiếu nại, tố cáo; quản lý tổ chức bộ máy, nhân sự, tài chính, tài sản và các nguồn lực được giao theo quy định của pháp luật.