Hiện nay, hệ thống y tế công lập do thành phố Hà Nội quản lý gồm 42 bệnh viện, 11 cơ sở trợ giúp xã hội và 126 trạm y tế xã, phường. Trên địa bàn còn có 35 bệnh viện Trung ương, Bộ, ngành cùng khoảng 5 nghìn cơ sở khám chữa bệnh và 10 nghìn cơ sở kinh doanh dược ngoài công lập, góp phần giảm tải cho y tế công lập và bảo đảm cung ứng thuốc cho người dân.
Thực hiện Nghị quyết 72, ngành y tế Hà Nội tập trung đẩy mạnh chuyển đổi số, yêu cầu các cơ sở khám chữa bệnh tích hợp dữ liệu vào kho dữ liệu y tế thành phố, từng bước kết nối hồ sơ sức khỏe điện tử của người dân. Cùng với đó là xây dựng cơ sở dữ liệu tập trung về nguồn nhân lực y tế chất lượng cao; tăng cường hỗ trợ chuyên môn cho y tế cơ sở, phát triển mạng lưới cấp cứu ngoại viện, đẩy mạnh truyền thông giáo dục sức khỏe và tư vấn hiến, ghép tạng. Qua đó, hướng tới xây dựng hệ thống y tế Thủ đô hiện đại, đồng bộ, lấy người dân làm trung tâm phục vụ.