Đoạn cao tốc này bị ngập nặng trên cả hai chiều đường, kéo dài khoảng 300 m, khiến các phương tiện di chuyển chậm. Nhiều xe bị chết máy, dẫn đến ùn tắc kéo dài 2-3 km.
Lực lượng chức năng đã tổ chức phân luồng, yêu cầu các xe dưới 10 chỗ và xe tải dưới 2,5 tấn quay đầu trước trạm thu phí Pháp Vân. Chỉ có xe hợp đồng, xe khách, và xe tải trên 2,5 tấn được phép lưu thông qua đoạn đường này.
Các phương tiện nhỏ dưới 10 chỗ được khuyến cáo lựa chọn lộ trình khác, như quốc lộ 1A, để tránh bị ùn tắc.
Từ ngày 10/9, Cảnh sát giao thông đã bố trí phân luồng các phương tiện vào quốc lộ 1A thay vì đi đường cao tốc Pháp Vân – Cầu Giẽ . Xe từ Hà Nội có thể vào quốc lộ 1A và trở lại cao tốc tại nút giao Thường Tín. Xe đi từ Hà Nam về Hà Nội có thể ra cao tốc ở nút giao Vạn Điểm hoặc nút giao Thường Tín.
Pháp Vân Cầu - Giẽ là tuyến cao tốc huyết mạch phía Nam Hà Nội, với lưu lượng trung bình khoảng 70.000 - 80.000 phương tiện mỗi ngày đêm.
