Sau lượt về vòng play-off, 2 đội cuối cùng giành quyền vào vòng đấu bảng là Cebu ( Philippines) và Shan United (Myanmar). Cụ thể, C ebu vượt qua đại diện Brunei - Kasuka với tổng tỷ số 4-2 trong khi Shan United hạ Ezra của Lào với tổng tỷ số 3-1. Hai đại diện của Việt Nam là CLB CAHN và Nam Định sẽ có cuộc đối đấu với 2 cái tên trên tại các trận đấu vòng bảng.
Kết thúc trận đấu, Cebu được xác định thi đấu tại bảng A cùng CLB CAHN, Buriram United, BG Pathum United (Thái Lan), Selangor (Malaysia) và Tampines Rovers (Singapore). Trong khi đó, Shan United ở bảng B cùng với Nam Định, Bangkok United (Thái Lan), Johor Darul Ta'zim (Malaysia), Lion City Sailors (Singapore) và Svay Rieng (Campuchia).
Vòng bảng Cúp C1 Đông Nam Á 2025/2026 sẽ diễn ra từ tháng 8/2025 đến tháng 2/2026. Các đội sẽ đá 5 trận vòng bảng (mỗi đội đá sân nhà 2 hoặc 3 trận) để chọn ra 2 đội nhất, nhì mỗi bảng vào thi đấu bán kết. Các trận bán kết và chung kết sẽ diễn ra theo thể thức lượt đi, lượt về vào tháng 5/2026.
